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Mentre le prove del DNA diventano più comuni, i ricercatori rapidamente aggiungono l'attrezzatura per continuare
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A meno che il vostro guardaroba di carriera consista dei cappotti bianchi multipli del laboratorio ed il vostro ufficio ha un nascondiglio delle provette, probabilmente non vi ricordate dove eravate quando è stato annunciato che il genoma umano era stato ordinato.
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Ma, se sapere che potete ora sciorinare $100 per tracciare la vostra migrazione ancestrale con la storia, il termine «DNA» può rotolare fuori dalla lingua come il ABCs.
L'impulso nella ricerca genetica e nella sua accettazione aumentante nel grande pubblico preannuncia bene per le scoperte di salute, dell'agricoltura e delle risorse naturali — per non menzionare entusiasti di genealogia. Ciò ha scienziati che si defilano per continuare con la tecnologia, secondo Charlie Johnson, direttore della genomica e della bioinformatica al Texas A&M AgriLife Research in College Station.
È stato 20 per anno più produttivi da quando due genoma batterici in primo luogo sono stati ordinati nel 1995, secondo gli istituti nazionali del centro Salute-nazionale per informazioni di biotecnologia. Quasi 125.000 organismi sono stati ordinati, includenti — per aiutare puntuale la vostra ascendenza — il genoma umano nel 2003.
«La tecnologia è relativamente nuova. Prima del 2007, ordinare era molto difficile, lento e laborioso,» Johnson ha detto. «Il progetto Genoma Umano, per esempio, ha cominciato nel 1990 ed ha richiesto 13 anni per completare ad un costo di circa $3 miliardo.»
Una volta che la scienza ottenesse una stretta della tecnologia, tuttavia, i ricercatori dall'agricoltura alla zoologia hanno visto chiaramente come scrutare nel livello più interno di esistenza di un organismo potrebbe contribuire ad affrontare le edizioni quali la malattia, la siccità e la pestilenza.
Un problema, tuttavia, è stato costato, Johnson ha notato.
«Il genere di strumenti stati necessari per fare l'ordinamento non è accessibile affinchè un singolo laboratorio possieda,» ha detto. «In media, hanno costato circa $1 milione per uno. E per tutto il un ricercatore sarebbe duro generare abbastanza lavoro di ricerca per giustificare quell'investimento.»
La ricerca di AgriLife, con la sua estesa rete scientifica attraverso il Texas, ha preveduto una più grande immagine. Nel 2010, l'agenzia ha impiegato Johnson per stabilire un'anima di attrezzatura e di un insieme degli scienziati con esperienza della tecnologia di genomica che potrebbero sostenere i ricercatori in un redditizio, modo efficace. Ancor più, forniscono la loro competenza agli scienziati in tutto il Texas A&M University System.
«La nostra reputazione per eccellenza scientifica e dati di alta qualità ha condotto alle collaborazioni con gli scienziati intorno al mondo, compreso i gruppi in 35 paesi,» Johnson ha notato. «Cominciando nel 2009 quando la prima prossima generazione che ordina il sistema è stata acquistata e durante gli ultimi otto anni, AgriLife ha continuato a stare al passo con una tecnologia che sta cambiando così velocemente. Il costo di ordinamento è caduto da $3 miliardo per il primo genoma umano meno di $1.000 ad oggi e si pensa che immerga inferiore a $100 nei prossimi anni.»
Questo mese, il centro stabilirà un Illumina NovaSeq 6000, una macchina Johnson ha detto può rendere l'equivalente di 48 genoma umano di taglia in meno di due giorni. Ciò ridurrà significativamente i costi.
«Il Texas A&M AgriLife è una delle prime istituzioni accademiche per avere accesso a questa tecnologia,» Johnson ha detto. «Questo è lo strumento giusto al momento giusto affrontare questa nuova era di grande agri-genomica e siamo entusiasmati per fa parte di.»
In pratica, come il suo cellulare, il DNA che ordina la tecnologia è in evoluzione ad un passo frenetico, ha detto.
«Se non state migliorando costantemente, cadete rapidamente dietro. Lavoriamo difficile da ottenere queste nuove macchine in modo da possiamo continuare a fornire i dati più di alta qualità facendo uso di ultime tecnologie genomiche per dare ai nostri collaboratori il più grande colpo per il dollaro,» ha detto.
Il centro ha più di 350 ricercatori principali nella collaborazione e si è sviluppato «essenzialmente dal fare alcuni progetti un anno ora basicamente ad aggiungere l'un progetto un il giorno,» Johnson ha notato.
Ed il sequenziamento del genoma fa parte soltanto dello sforzo. Il gruppo di Johnson inoltre ha un programma di ricerca attivo di bioinformatica, fornente l'analisi dei dati per i ricercatori.
«Il sequenziamento del genoma redige una quantità enorme di dati,» ha detto. «Immagini una pila delle biblioteche di enciclopedie. Frantumile su in un apparecchio per distruggere i documenti e finite con le serie di lettere. La sfida è di rimettere tutto quelli insieme nel libro che descrive che cosa avete ordinato. Poi potete usare quelle informazioni per fare una certa scoperta o per scoprire qualche cosa di utile.»