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Ottener con faticae un posto adatto analitico

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Seduta con… Renã Robinson, assistente universitario, dipartimento di chimica e principale Investigator al laboratorio di RASR, università di Pittsburgh, Pensilvania, U.S.A.

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Come siete entrato in chimica analitica?

Come componente della mia ricerca in chimica dello studente non laureato, ho usato GC-MS e LC-MS per individuare gli acidi grassi nel glaucoma. Era la mia prima esposizione a usando la spettrometria di massa per le applicazioni biologiche – ed immediatamente sono stato eccitato dalle possibilità. Ad Indiana University, ho scelto un progetto della dissertazione facendo uso dei metodi analitici di spettrometria di massa per studiare le proteine e l'invecchiamento nelle mosche della frutta. Ho usato il mobilità-ms dello ione, che ha aggiunto un'altra dimensionalità ai dati, aumentanti lo spazio della separazione e permettenti che me vedi più proteine di basso concentrazione. Era un progetto di ricerca molto interdisciplinare e di collaborazione e tutto era nuovo a me – dalla genetica delle mosche della frutta a vagliare con le quantità enormi di dati di proteomics per ottenere qualche cosa di significativo. Era emozionante lavorare nel campo nel della metà del 2000 s, quando il proteomics aveva cominciato appena trasformarsi in in un gran cosa.

Come ha proteomics cambia da allora?

Il campo si è mosso dall'instaurazione dei metodi iniziali per misurare le proteine a strumentazione d'avanzamento in tal modo che permette che noi profiliamo gli interi proteomes con la sensibilità incredibile, per individuare le differenze in individui malati ed in buona salute. Abbiamo ottenuto realmente buoni per rapidamente analizzare i dati risultanti e la focalizzazione sulle implicazioni funzionali per le proteine. La domanda ora è: come possiamo analizzare le reti dinamiche ed utilizziamo le informazioni spaziali e temporali nel migliore modo avanzare la ricerca?

Dove la vostra ricerca vi ha preso dopo il vostro PhD?

Collaborando con un collega che stava lavorando alla malattia del Parkinson ha scintillato il mio interesse nelle possibilità di applicazione del ms nelle malattie relative all'età. Ho collegamenti personali al morbo di Alzheimer (ANNUNCIO) ed ho voluto scavare più profondo nei meccanismi dietro il neurodegeneration. Ho cominciato cercare le opportunità postdottorali dove potrei mettere a fuoco di più su patologia relativa all'età. Un aspetto universale di invecchiamento è un declino nel sistema immunitario, che mi ha condotto a mettere a fuoco il mio lavoro sul ruolo del immunosenescence nella malattia relativa all'età.

Che cosa sono i vostri progetti in corso?

Stiamo usando la tecnologia di Orbitrap – spettrometri di massa molto ad alta definizione e sensibili – per effettuare gli esperimenti di multiplazione (ms, poi MS/MS e poi MS/MS/MS) studianti come le proteine cambiano durante invecchiamento e il immunosenescence e cercanti gli obiettivi potenziali della droga nella malattia neurodegenerative. È lavoro emozionante – stiamo vedendo le cose che non sono state vedute mai prima. Per esempio, abbiamo potuti determinare che il fegato svolge un ruolo significativo nel morbo di Alzheimer identificando molte proteine con l'espressione differente nei modelli del topo dell'ANNUNCIO confrontati ai tipi selvatici. Ulteriormente, abbiamo cominciato a capire meglio gli effetti dello sforzo ossidativo in ANNUNCIO misurando nitrato e proteine di S-nitrosylated. Mentre siamo informati che l'ANNUNCIO è una malattia di cervello, abbiamo dati significativi di proteomics per indicare che gli organi periferici inoltre hanno un ruolo importante. I nostri progetti in corso sono innestati verso la comprensione della natura sistema di ampiezza dell'ANNUNCIO e la determinazione se ci sono sistemi che rendono a popolazioni sicure più a rischio dell'ANNUNCIO di sviluppo.

Che cosa vi motiva?

È un regalo e un privilegio fare questo tipo di ricerca; Ritengo come questo sono il mio scopo. Il pensiero di tutta la gente che sta lascianda devastante dall'ANNUNCIO mi tiene messo a fuoco. Mi ricorda che dobbiamo tendere a più appena miglioramenti incrementali nella nostri tecnologia e approccio analitico – c'è una più grande immagine che dobbiamo tenere presente.

Che cosa è seguente per il vostro laboratorio?

Il nostro laboratorio sta muovendosi verso l'università di Vanderbilt questa estate. Ci sono lotti delle opportunità a Vanderbilt di fare la spettrometria di massa realmente di prima qualità – e di impegnarsi con la memoria & il centro di Alzheimer per aiutare ulteriore ricerca in questa area. Potremo aggiungere al nostro repertorio degli approcci e delle tecniche e rinforziamo le nostre piattaforme di massa e le tecnologie di spec. Così come le proteine, siamo interessati in lipidi di misurazione ed altri metaboliti. Il gruppo già ha molta competenza analitica, ma stiamo progettando di ampliare le nostre capacità nell'informatica e nella biologia funzionale, per permettere che noi continuiamo sui nostri risultati di proteomics. Siamo eccitati specialmente per avere più accesso ai campioni umani nella clinica. In dieci anni, spero che abbiamo potuti aiutare la ricerca di avanzamento dell'ANNUNCIO – e siamo un punto più vicino ad un efficace trattamento.

Congratulazioni sulla conquista del premio al successo 2017 di conferenza di Pittsburgh…

Era un punto culminante reale, essere presentato particolarmente il premio da Sarah Trimpin (ora a Wayne State University). Sara è stato un mentore a me da quando era un postdoc ed ero uno studente di PhD all'Indiana. Mi ha mostrato che come spingere via ad un problema e dargli tutto avessi! Lavora estremamente duro ed estremamente astuto; non solo ha fatto così tanto con le tecniche e la spettrometria di massa di ionizzazione, ma inoltre considera ogni angolo che potreste avvicinarti ad un problema particolare. Ha ottenuto con fatica un posto adatto per se stessa e mi ha ispirato chiedersi, «che cosa sta andando essere la mia cosa?»

E che cosa è la vostra «cosa»?

Spero che possa osservare indietro la mia carriera e dire il mio posto adatto era sviluppante ed applicante il proteomics quantitativo in un modo che ha avanzato la nostra comprensione dell'ANNUNCIO e dell'invecchiamento – specificamente, come le cose fuori del cervello sono collegate con cui sta accadendo nel cervello. Dall'inizio, ho saputo che ho voluto intraprendere un problema nelle sanità ed uso il mio skillset analitico per contribuire a rispondere a quel problema.