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Paesaggio genomica funzionale di AML Analyzed

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La leucemia mieloide acuta è un cancro della linea mieloide di globuli, caratterizzata dalla crescita rapida delle cellule anormali che si accumulano nel midollo osseo e nel sangue ed interferiscono con i globuli normali.

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L'implementazione delle terapie mirate a per la leucemia mieloide acuta (AML) sta sfidando a causa dei modelli mutational complessi all'interno di ed attraverso i pazienti come pure una penuria di agenti farmacologici per la maggior parte dei eventi mutational.

Gli scienziati ad Oregon Health & Science University (Portland, O, U.S.A.) hanno usato l'ordinamento, il RNA del exome ordinanti e/o ex vivo prove di sensibilità della droga per profilare fino a 672 campioni del tumore da 562 pazienti di AML. Oltre ad identificare le mutazioni ricorrenti non descritte precedentemente nella circostanza, hanno scoperto i modelli di risposta del trattamento che hanno corrisposto alle firme specifiche di combinazioni o di espressione genica di mutazione.

Come componente di un programma chiamato batta AML, il gruppo ha fatto il exome di Illumina HiSeq 2500 della accoppiare-fine che ordina su 622 dei campioni del tumore. Inoltre hanno eseguito il RNA che ordina su 451 campione del tumore da 411 paziente di AML e sulla prova di sensibilità della droga con 122 droghe su 409 campioni del tumore da 363 pazienti di AML.

Il gruppo ha scoperto i profili del transcriptome connessi con le frequenti mutazioni del tumore o sottoinsiemi del tumore con le caratteristiche citogenetiche specifiche come pure le combinazioni di mutazione e di espressione genica presenti in cui i tumori hanno fatto o non fatto risposta alle varie droghe. Dove la farmacoresistenza era comune in tumori che contengono le mutazioni in TP53, nelle EKA, in KRAS, in IDH1, o nel gene trascrizionale ASXL1 di regolatore-codifica, hanno notato che tumori mutazione-positivi IDH2 tesi verso la sensibilità della droga. L'analisi del gruppo inoltre ha evidenziato le sensibilità specifiche della droga che corrispondono ai trattamenti mirati a quali la chinasi della MAPPA, PIK3C, mTOR, o gli inibitori di JAK. Questi ed altri dati sono a disposizione di altri scienziati online attraverso uno spettatore di dati hanno chiamato Vizome.

Jeffrey Tyner, il PhD, un professore associato e l'autore principale dello studio, hanno detto, ««il nostro gruppo di dati può essere utile da vedere se quella mutazione genetica particolare corrisponde a determinate sensibilità della droga. Crediamo che questo gruppo di dati aiuti i medici a risolvere più facilmente quei generi specifici di domande.» Lo studio è stato pubblicato il 17 ottobre 2018, nella natura del giornale.