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L'array D3™ sta colmando le lacune lasciate da NGS e qPCR

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PathogenDx si sta espandendo nei laboratori clinici, fornendo test multiplex a basso costo con il D3 Array™

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Dall'avvento dei microscopi alla reazione a catena della polimerasi quantitativa (qPCR) e al sequenziamento di nuova generazione (NGS), i laboratori clinici sono più capaci che mai di eseguire test diagnostici efficaci. Tuttavia, anche i potenti strumenti diagnostici di oggi non possono fare tutto: c'è ancora bisogno di nuovi progressi per accelerare e migliorare i test clinici.

Laddove la qPCR e l'NGS non riescono ad arrivare, PathogenDx cerca di colmare le lacune affrontando le sfide in termini di prestazioni, produttività e costi per quanto riguarda i test multipli con l'espansione della sua piattaforma D3 Array™.

Il nuovo D3 Array™ ampliato

Originariamente sviluppato per il settore della cannabis, i ricercatori di PathogenDx sapevano che il loro array era in grado di fare molto di più e hanno puntato al settore clinico. All'inizio è stato difficile entrare in questi settori, poiché uno dei grandi punti di forza del D3 Array™ è la sua capacità di analizzare quasi 100 target in triplo in un tempo relativamente breve, rendendolo ideale per l'analisi delle varianti, cosa che in precedenza non era considerata necessaria.

"Il governo e i medici direbbero che non c'è utilità clinica nei test delle varianti", afferma Milan Patel, CEO e cofondatore di PathogenDx, che ha recentemente parlato con Lab Manager. Tuttavia, quando il mondo è stato colpito dalla COVID-19, la richiesta di test rapidi sulle varianti è aumentata drasticamente. "Siamo riusciti a rilevare [utilizzando il D3 Array™] non solo la SARS-CoV-2, ma anche varianti importanti dal punto di vista clinico"

Dimostrando l'utilità del D3 Array™ durante l'apice della pandemia, PathogenDx ha posizionato il proprio array per affiancare strumenti diagnostici come la qPCR e l'NGS nel settore clinico. "La prossima evoluzione naturale dell'uso della nostra tecnologia è nell'area delle malattie infettive", afferma l'esperto.

Patel e gli sviluppatori del D3 Array™ si sono anche resi conto che questa forma di analisi non ha valore esclusivamente per la diagnostica umana, ma può essere utilizzata anche nei settori alimentare e agricolo. La Salmonella, ad esempio, ha anche varianti che causano infezioni, quindi PathogenDx ha creato un test di sierotipizzazione della Salmonella per il D3 Array™ che valuta 13 diverse sottospecie di Salmonella nello stesso test.

La capacità di spostarsi rapidamente in questi altri settori è un altro punto di forza del D3 Array™, che è altamente standardizzato in diversi laboratori. "L'array non è diverso da quello che si vede in un array di test sulla cannabis o in un array clinico o in un array alimentare. È lo stesso array. Se si esamina l'E. Coli nella cannabis e si esamina l'E. Coli in un pannello GI per uso clinico o l'E. Coli negli alimenti, si tratta dello stesso identico array: i primer e le sonde sono tutti uguali", afferma Patel. "Questo è il bello della tecnologia"

Veloce, conveniente e preciso

Sebbene la qPCR e l'NGS siano strumenti potenti e utili, rimangono delle lacune nel mercato dei test diagnostici. In particolare, per quanto riguarda la qPCR, i test in multiplexing hanno spesso un rendimento limitato, mentre la NGS, che ha un rendimento ancora più basso, richiede tempi di esecuzione lunghi e costi proibitivi. Per rispondere a questi problemi, D3 Array™ vanta un'elevata produttività e velocità, oltre a rappresentare un'opzione molto più conveniente per i laboratori diagnostici.

"Le cose migliori del [D3 Array™] sono che è una frazione del costo del sequenziamento next-gen, fornisce lo stesso livello di capacità di multiplexing del sequenziamento next-gen e supera tutto ciò che può fare la qPCR", dice Patel. Mentre l'NGS può richiedere settimane per fornire risultati, il D3 Array™ richiede solo giorni, il che significa che i medici possono sviluppare piani di trattamento più rapidamente e fornire una medicina di precisione a ritmi più efficienti ed economici".

UTI e non solo

PathogenDx intende continuare a espandere l'uso del D3 Array™ in altre aree cliniche che utilizzano test multiplex, come la diagnosi delle infezioni delle vie urinarie (UTI) e la resistenza agli antibiotici dei patogeni che causano infezioni, con potenziali applicazioni nella salute delle donne e nella diagnostica del cancro. Il D3 Array™ può anche avere potenziali applicazioni nella teleassistenza e nei test diagnostici a domicilio in alcuni casi d'uso, come le IST.

Indipendentemente dal futuro, le menti di PathogenDx sono fiduciose che il D3 Array™ guiderà la carica verso una migliore diagnostica per fornire ai medici informazioni più efficaci per la diagnosi e il trattamento, oltre a test multipli migliori e più convenienti. "Ci sono problemi rispetto a [qPCR e NGS] che questa particolare tecnologia di microarray D3 Array™ risolve completamente in termini di esigenze del mercato", afferma Patel, "che si tratti di malattie infettive nell'area della diagnostica molecolare o di altre applicazioni multiplex"